A型インフルエンザウイルスには、ヘマグルチニン（HA：Hemagglutinin）とノイラミニダーゼ（NA: Neuraminidase）の2種類の突起（スパイク）状のタンパク質があります。Ｂ型インフルエンザウイルスにもHAとNAがありますが、それぞれ1種類しかありません。Ｃ型インフルエンザウイルスにはヘマグルチニンエステラーゼ（HE）しかありません。流行を起こすインフルエンザウイルスはＡ型とＢ型で、Ｃ型は軽いかぜ症状のみです。

HA（ヘマグルチニン）は感染しようとする細胞に結合し、ウイルスを細胞の中に取り込む役割をします。NA（ノイラミニダーゼ）は、感染した細胞とHAの結合を切って、複製されたウイルスを細胞から放出させる役割を持っています。タミフルはNAを阻害して、ウイルスを細胞から外に出さないようにする薬です。

Ａ型インフルエンザウイルスのHAには16種類（H1～H16）、NAには9種類（N1～N9）あり、この組み合わせによりＡ型インフルエンザウイルスにはH1N1～H16N9の144種類の亜型が存在します。ヒトインフルエンザの亜型にはH1N1（スペイン風邪1918年、2009年）、H2N2（ロシア風邪1957年）、H3N2（香港風邪1968年）、H5N1（鳥から人へ感染）、H7N9（鳥インフルエンザ2013年）などがあります。